ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) ఫైల్ అనేది త్రిమితీయ జీవ డేటాను నిల్వ చేయడానికి ఉపయోగించే ఫైల్ ఫార్మాట్. PDB ఫైల్స్ సాధారణంగా ప్రోటీన్లు, న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాలు మరియు ఇతర జీవఅణువులపై డేటాను నిల్వ చేయడానికి ఉపయోగిస్తారు. PDB ఫైల్‌లను PyMOL మరియు VMD వంటి సాఫ్ట్‌వేర్‌లతో సహా వివిధ మార్గాల్లో వీక్షించవచ్చు. Windows 11లో, మీరు ఫైల్ ఎక్స్‌ప్లోరర్‌కి వెళ్లి, వీక్షణ ట్యాబ్‌పై క్లిక్ చేసి, ఆపై దాచిన ఫైల్‌లు మరియు ఫోల్డర్‌లను చూపించే ఎంపికను ఎంచుకోవడం ద్వారా PDB ఫైల్‌ను తెరవవచ్చు. మీరు దీన్ని చేసిన తర్వాత, మీరు చూడాలనుకుంటున్న PDB ఫైల్‌ను మీరు గుర్తించగలరు. జీవఅణువులతో పనిచేసే శాస్త్రవేత్తలకు PDB ఫైల్‌లు ఒక ముఖ్యమైన సాధనం, ఎందుకంటే అవి మూడు కోణాలలో డేటా యొక్క విజువలైజేషన్ మరియు విశ్లేషణకు అనుమతిస్తాయి. బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ లేదా కంప్యూటేషనల్ బయాలజీ రంగంలో పనిచేసే ఎవరికైనా PDB ఫైల్‌లను ఎలా తెరవాలో మరియు వీక్షించాలో అర్థం చేసుకోవడం ఒక ముఖ్యమైన నైపుణ్యం.
ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) ఫైల్‌లు పరమాణు నిర్మాణాలను నిల్వ చేసే త్రిమితీయ పరమాణు ఫైళ్లు. ఇప్పుడు, మీరు PC లో అటువంటి ఫైల్‌లను ఎలా తెరవాలని ఆలోచిస్తున్నట్లయితే, ఈ పోస్ట్ మీకు ఆసక్తిని కలిగిస్తుంది. ఇక్కడ మేము PDB ఫైల్‌లను వివరంగా చర్చిస్తాము మరియు Windows 11/10లో అటువంటి ఫైల్‌లను ఎలా వీక్షించాలి. కాబట్టి, మరింత ఆలస్యం లేకుండా, దాన్ని తనిఖీ చేద్దాం!
ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) ఫైల్ అంటే ఏమిటి?
ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) అనేది ప్రోటీన్లు, న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాలు మరియు ఇతర పెద్ద అణువుల కోసం 3D నిర్మాణాత్మక డేటా యొక్క డేటాబేస్. నుండి ఫైల్ GDP ఫైల్ పొడిగింపు అనేది ప్రాథమికంగా 3D బయోలాజికల్ మాలిక్యూల్ యొక్క నిర్మాణానికి సంబంధించిన డేటాను కలిగి ఉన్న ఫైల్. డేటాలో అటామిక్ కోఆర్డినేట్‌లు, అటామిక్ స్ట్రక్చర్‌లు, అటామిక్ కనెక్టివిటీ, ప్రోటీన్ స్ట్రక్చర్, న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ స్ట్రక్చర్ మరియు మరిన్ని ఉన్నాయి. ఇది ప్రయోగాత్మక మెటాడేటాను కూడా కలిగి ఉంది.
ప్రోటీన్ కోఆర్డినేట్‌లను మార్పిడి చేయడానికి బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్‌లో ఈ ఫైల్ ఫార్మాట్ విస్తృతంగా ఉపయోగించబడుతుంది. ఇది ప్రోటీన్ యొక్క నిర్మాణాన్ని వివరించే వేల పంక్తులను కలిగి ఉంటుంది. ఇప్పుడు, మీరు Windows PCలో PDB ఫైల్‌లను చదవాలనుకుంటే లేదా వీక్షించాలనుకుంటే, దాని కోసం స్థానిక అనువర్తనం లేనందున మీరు ప్రత్యేక మూడవ పక్ష సాధనాన్ని ఉపయోగించాలి. ఈ పోస్ట్‌లో, మేము Windows 11/10లో PDB ఫైల్‌ను వీక్షించడానికి వివిధ మార్గాలను చర్చిస్తాము.
Windows 11లో ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) ఫైల్‌ను ఎలా చూడాలి?
Windows 11/10లో ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) ఫైల్‌ను వీక్షించడానికి రెండు మార్గాలు ఉన్నాయి, అవి:
- PDB ఫైల్‌లను వీక్షించడానికి ఉచిత సాఫ్ట్‌వేర్‌ను ఉపయోగించండి.
- PDB ఫైల్‌లను చదవడానికి ఉచిత ఆన్‌లైన్ సాధనాన్ని ప్రయత్నించండి.
1] PDB ఫైల్‌లను వీక్షించడానికి ఉచిత సాఫ్ట్‌వేర్‌ను ఉపయోగించండి.
మీరు PDB ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వీక్షించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతించే మూడవ పక్ష Windows సాఫ్ట్‌వేర్‌ను ఉపయోగించవచ్చు. మీరు ప్రయత్నించగల Windows కోసం అనేక ఉచిత డెస్క్‌టాప్ యాప్‌లు అందుబాటులో ఉన్నాయి. మీరు ఉపయోగించగల కొన్ని మంచివి ఇక్కడ ఉన్నాయి:
- IQmol
- స్విస్-PdbViewer
- క్యూమోల్
- ఒక అణువు
- రాస్మోల్
A] IKmol
IQmol అనేది Windows 11/10 కోసం ఉచిత మరియు ఓపెన్ సోర్స్ మాలిక్యులర్ ఎడిటర్ మరియు విజువలైజేషన్ సాఫ్ట్వేర్. దీన్ని ఉపయోగించి, మీరు PDBతో పాటు MOL, SMI, CUBE, XYZ మొదలైన అనేక ఇతర 3D మాలిక్యూల్ ఫైల్‌లను వీక్షించవచ్చు. ఈ సాఫ్ట్‌వేర్‌లో, మీరు అన్ని ముఖ్యమైన మాలిక్యులర్ విజువలైజేషన్ సాధనాలను కనుగొనవచ్చు. ఈ సాధనాలు ప్రాథమిక నుండి అధునాతనమైనవి. PDB ఫైల్‌ను వీక్షించడంతో పాటు, మీరు పరమాణు నిర్మాణాన్ని కూడా సవరించవచ్చు.
ఇది ఒకే సమయంలో బహుళ PDB ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వాటిని ఒకే సమయంలో వీక్షించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మోడల్ వ్యూ ప్యానెల్‌లో, మీరు ఒకటి లేదా అంతకంటే ఎక్కువ PDB ఫైల్‌ల రెండరింగ్‌ను ప్రారంభించవచ్చు లేదా నిలిపివేయవచ్చు.
IQmol యొక్క ప్రధాన లక్షణాలు:
మీరు చూడగలిగే ఈ ఉచిత మరియు ఓపెన్ సోర్స్ PDB ఫైల్ వ్యూయర్ యొక్క లక్షణాలు:
- మీరు జూమ్ ఇన్/జూమ్ అవుట్ (మౌస్ వీల్‌తో), పాన్, రొటేట్, ఫుల్ స్క్రీన్, రీసెట్ వ్యూ, షో యాక్సెస్ మొదలైన వాటితో సహా అన్ని ప్రామాణిక ఫైల్ బ్రౌజింగ్ సాధనాలను కనుగొనవచ్చు.
- షేడర్, యాంబియంట్ లైట్, డిఫ్యూజన్, పొగమంచు బలం, ముఖ్యాంశాలు, శబ్దం తీవ్రత, POV-రే పారామితులు మొదలైన పారామితులను సవరించడం ద్వారా మోడల్ రూపాన్ని అనుకూలీకరించడానికి ఇది మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది.
- మీరు అణువు ద్రవ్యరాశి, పాక్షిక ఛార్జ్, NMR, స్పిన్ సాంద్రత మొదలైన అటామిక్ లేబుల్‌లను కూడా జోడించవచ్చు.
- ఇది కెమెరా సెట్టింగ్‌లను మీకు నచ్చిన విధంగా అనుకూలీకరించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు కెమెరా ప్రొజెక్షన్, స్థానం మొదలైనవాటిని సర్దుబాటు చేయవచ్చు.
- ఒక అనుకూలమైన కలిగి ఆటోమేటిక్ రొటేషన్ పరమాణు నమూనాను స్వయంచాలకంగా తిప్పడానికి మిమ్మల్ని అనుమతించే ఒక ఫంక్షన్.
- మీరు PNG, PPM, BMP, JPG, PS, EPS మొదలైన చిత్ర ఆకృతిలో ప్రస్తుత ప్రోటీన్ నిర్మాణ ప్రాతినిధ్యాన్ని సేవ్ చేయవచ్చు.
- ఇది 'సేవ్ యాజ్' ఫీచర్‌ని ఉపయోగించి PDBని ఇతర మాలిక్యూల్ ఫైల్‌లకు మార్చడానికి కూడా మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మద్దతు ఉన్న అవుట్‌పుట్ ఫార్మాట్‌లు: XYZ, MOL, MOL2, CML, మొదలైనవి.
- మీరు కూడా ఉపయోగించవచ్చు లెక్కింపు లెక్కించడానికి విధులు పరమాణు నిర్మాణ శక్తి, శక్తులు, PES స్కాన్, పరివర్తన స్థితి, రసాయన మార్పులు, జ్యామితి, కుళ్ళిపోయే శక్తి, BSSE దిద్దుబాటు, మరియు అందువలన న.
వీక్షణ ఫంక్షన్‌లతో పాటు, మీరు పరమాణు నిర్మాణ ఫంక్షన్‌ల సెట్‌తో ప్రత్యేక బిల్డ్ మెనుని పొందుతారు. ఈ లక్షణాలలో కొత్త అణువులను జోడించడం, కొత్త అణువులను చొప్పించడం, నిర్మాణాన్ని తగ్గించడం, ఐసోటోప్‌లను సెట్ చేయడం మరియు మరిన్ని ఉన్నాయి.
ఇది నిజంగా మంచి మాలిక్యులర్ మోడలింగ్ సాఫ్ట్వేర్, దీనితో మీరు మీ PCలో ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ ఫైల్‌లను దృశ్యమానం చేయవచ్చు. మీకు నచ్చితే డౌన్‌లోడ్ చేసుకోండి ఇక్కడనుంచి .
చూడండి: Chem4Word అనేది మైక్రోసాఫ్ట్ వర్డ్ కోసం కెమిస్ట్రీ యాడ్-ఇన్. .
B] స్విస్-PdbViewer
Swiss-PdbViewer అనేది Windows 11/10 కోసం ప్రత్యేక ఉచిత PDB ఫైల్ వ్యూయర్. ఇది ఏకకాలంలో అనేక ప్రోటీన్ నిర్మాణాలను దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు PDB ఫైల్‌లో ఉన్న ప్రోటీన్ నిర్మాణం, DNA నిర్మాణం మొదలైనవాటిని విశ్లేషించవచ్చు. PDB ఫైల్ కాకుండా, MOL మరియు MMCIF ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వీక్షించడానికి కూడా ఇది మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది.
మీరు PDB ఫైల్‌ను తెరిచినప్పుడు, కంట్రోల్ ప్యానెల్ విండోతో పాటు ఇంటర్‌ఫేస్‌లో 3D వీక్షణ ప్రదర్శించబడుతుంది. నియంత్రణ ప్యానెల్ సాధారణ సమాచారం, జాబితా మరియు ఫైల్ శీర్షికను కలిగి ఉంటుంది. మీరు నిర్మాణాన్ని సులభంగా తరలించవచ్చు, దాన్ని తిప్పవచ్చు, జూమ్ ఇన్/అవుట్ చేయవచ్చు మొదలైనవి.
ఇది మీ ప్రాధాన్యతల ప్రకారం డాట్ ఉపరితలం, బేస్, హైడ్రోజన్ బాండ్‌లు, ఫోర్స్ వెక్టర్స్ మరియు మరిన్నింటిని చూపించడానికి లేదా దాచడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు నిర్మాణాన్ని మెరుగ్గా విశ్లేషించడానికి వివిధ రంగు పథకాలతో విభిన్న భాగాలను కూడా హైలైట్ చేయవచ్చు. అదనంగా, మీరు రెండర్ ఇన్ సాలిడ్ 3D, రెండర్ POV, డిస్‌ప్లే లేబుల్‌లు మరియు మరిన్ని వంటి ప్రదర్శన లక్షణాలను ఉపయోగించవచ్చు.
విజువలైజేషన్ టూల్స్‌తో పాటు, మీరు చాలా మాలిక్యులర్ మోడలింగ్ ఫీచర్‌లను కూడా పొందుతారు. అదనంగా, ఇది శక్తి గణన, H-బాండ్ లెక్కింపు, డొమైన్ విశ్లేషణ, డొమైన్ గుర్తింపు, 3D మోటిఫ్ సృష్టి, స్ఫటికాకార సమరూప భవనం మరియు ఇతర సాధనాలను కూడా కలిగి ఉంది.
మీరు దీన్ని డౌన్‌లోడ్ చేసుకోవచ్చు అధికారిక సైట్ .
చదవండి: Windows 11/10 కోసం ఉత్తమ ఉచిత శక్తి విశ్లేషణ సాఫ్ట్వేర్.
సి] QMol
క్యూమోల్ Windows 11/10 కోసం మరొక ఉచిత PDB వ్యూయర్. ఇది మీరు PDB ఫైల్‌లను వీక్షించగల స్థూల కణ నిర్మాణ విజువలైజేషన్ సాధనం. DX, MAP, MTZ, CNS మొదలైనవి మీరు తెరవగల మరియు వీక్షించగల ఇతర ఫైల్‌లు.
ఇది దృక్కోణం మరియు ఆర్థోగ్రాఫిక్ వీక్షణల మధ్య మారడానికి, మోడల్‌ను తిప్పడానికి, జూమ్ ఇన్/అవుట్ చేయడానికి, మొదలైన వాటిని అనుమతిస్తుంది. మీరు POV-Ray మరియు దాని యానిమేషన్ రెండరింగ్ పద్ధతులను ఉపయోగించి మోడల్‌ను రెండర్ చేయవచ్చు. రెండర్ చేయబడిన నిర్మాణాన్ని PNG ఆకృతిలో సేవ్ చేయవచ్చు. మోడల్‌లో దూరం, కోణం మరియు ట్విస్ట్‌ను కొలవడానికి మిమ్మల్ని అనుమతించే కొలత సాధనం కూడా అందుబాటులో ఉంది.
ప్రోటీన్ నిర్మాణాన్ని మరింత విశ్లేషించడానికి మీరు కొన్ని అదనపు సాధనాలను కూడా కనుగొనవచ్చు. ఈ సాధనాలు ఉన్నాయి మాలిక్యులర్ సూపర్‌పొజిషన్, మోల్ సర్ఫేస్ కట్టర్, మోల్ సర్ఫేస్ జనరేషన్, మోల్ బాండ్ ఎడిటర్, ఇంటరాక్షన్ అనాలిసిస్, మోల్ మార్ఫ్ యానిమేషన్, మరియు అందువలన న.
PDB ఫైల్‌లలో ఉండే ప్రోటీన్ నిర్మాణాన్ని దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి ఇది మంచి సాఫ్ట్వేర్.
చూడండి: .LIT ఎంపిక # Windowsలో LITని EPUB లేదా MOBIకి మార్చడం ఎలా?
ఇమెయిల్ బ్యాకప్ సాఫ్ట్వేర్
D] అణువులు
ఈ జాబితాలోని తదుపరి PDB వ్యూయర్ సాఫ్ట్వేర్ మోలెకెల్. ఇది చాలా పాతది కాని శక్తివంతమైన మాలిక్యులర్ విజువలైజేషన్ సాఫ్ట్వేర్, ఇది PDB ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వీక్షించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు ప్రోటీన్ నిర్మాణాలను విశ్లేషించడానికి అనుమతించే అనేక పరమాణు విజువలైజేషన్ మరియు విశ్లేషణ సాధనాలను కనుగొనవచ్చు.
అణువులు, పరమాణువులు, బంధాలు, అవశేషాలు మొదలైన వాటి ప్రదర్శనను అనుకూలీకరించడానికి ఇది మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు బాల్ & స్టిక్, CPK, హెమిస్పియర్, సోస్పియర్, ఫుల్ స్పియర్, సిలిండర్, సోసైలిండర్, సెమిసిలిండర్, వంటి వాటిలో ప్రతిదానికి విభిన్న ప్రదర్శన రకాలను ఎంచుకోవచ్చు. వైర్, స్టిక్, లీనియర్ టేప్ మొదలైనవి. అదనంగా, మీరు 3D వీక్షణ యొక్క లక్షణాలను సర్దుబాటు చేయవచ్చు, సరిహద్దు పెట్టెలను చూపించు/దాచవచ్చు, షేడర్‌లను ఉపయోగించవచ్చు, మొదలైనవి. ఇది ఉపరితలం యొక్క ఎలక్ట్రాన్ సాంద్రతను మార్చడం ద్వారా PDB ఫైల్‌ను వీక్షించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. నిర్మాణం మరియు ద్రావకం కోసం అందుబాటులో ఉన్న ఉపరితలాన్ని నిర్మాణానికి జోడించడం.
మీరు కనుగొనగలరు యానిమేషన్ అణువు యొక్క నిర్మాణం యొక్క యానిమేషన్‌ను ప్లే చేయడానికి దానిలోని ఒక ఫంక్షన్. దీనికి తగిన సాధనాలతో కూడిన ప్రత్యేక 'విశ్లేషణ' మెనూ కూడా ఉంది. విశ్లేషణ సాధనాలను ఉపయోగించి, మీరు గ్రిడ్ డేటా, భ్రమణ సాంద్రత, మాలిక్యులర్ ఎలెక్ట్రోస్టాటిక్ పొటెన్షియల్, ఎమిషన్ స్పెక్ట్రం, దూరం, కోణం మరియు మరిన్నింటిని నిర్మాణం కోసం నిర్ణయించవచ్చు.
ఇది PDB ఫైల్‌లను వివిధ ఫైల్ ఫార్మాట్‌లకు మార్చడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. ఈ ఫార్మాట్‌లలో PDF, PS, EPS మరియు ఇమేజ్ ఉన్నాయి. మీకు నచ్చితే మీరు దానిని పొందవచ్చు ఇక్కడ .
చదవండి: కంప్లీట్ అనాటమీ యాప్ Windows కోసం ఒక విలువైన డౌన్‌లోడ్. .
ఇ] రాస్మోల్
మీరు Windows 11/10లో PDB ఫైల్‌లను వీక్షించడానికి RasMolని కూడా ఉపయోగించవచ్చు. ఇది ఉచిత మరియు ఓపెన్ సోర్స్ సాఫ్ట్వేర్, ఇది పరమాణు నిర్మాణాలను దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. ఇది MOL, XYZ, CIF, MOPAC మొదలైన ఇతర ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వీక్షించడానికి కూడా మద్దతు ఇస్తుంది.
ఇది నిర్మాణాన్ని ఫ్రేమ్, వార్ప్, రాడ్లు, రిబ్బన్లు, తంతువులు మొదలైనవాటిని వీక్షించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు వివిధ రంగులతో నిర్మాణం యొక్క వివిధ భాగాలను కూడా హైలైట్ చేయవచ్చు. ఇది మీ ప్రాధాన్యతల ప్రకారం హైడ్రోజన్ అణువులు, హెటెరోటామ్‌లు, నీడలు, లేబుల్‌లు మొదలైనవాటిని చూపించడానికి లేదా దాచడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. మీరు నిర్మాణంలో దూరం, టోర్షన్, కోణం మరియు ఇతర విలువలను కూడా కొలవవచ్చు.
ఈ సాఫ్ట్వేర్ అందుబాటులో ఉంది ఇక్కడ .
చూడండి: Windows కోసం ఉత్తమ ఉచిత 3D హ్యూమన్ అనాటమీ సాఫ్ట్వేర్.
2] PDB ఫైల్‌లను చదవడానికి ఉచిత ఆన్‌లైన్ సాధనాన్ని ప్రయత్నించండి.
మీరు PDB ఫైల్‌లను తెరవడానికి మరియు వీక్షించడానికి ఉచిత ఆన్‌లైన్ సాధనాన్ని కూడా ఉపయోగించవచ్చు. మీరు చేయాల్సిందల్లా వెబ్‌సైట్‌ను వెబ్ బ్రౌజర్‌లో తెరిచి, దానిని వీక్షించడానికి PDB ఫైల్‌ను డౌన్‌లోడ్ చేసుకోండి. మీరు ప్రయత్నించగల కొన్ని మంచి ఉచిత ఆన్‌లైన్ PDB వీక్షకులు ఇక్కడ ఉన్నారు:
- RCSB PDB
- మోల్సాఫ్ట్
A] RCSB PDB
విండోస్ విశ్లేషణ విధాన సేవను ప్రారంభించలేకపోయాయి
మీరు ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ ఫైల్‌లను దృశ్యమానం చేయడానికి RCSB PDB అనే ఈ ఉచిత ఆన్‌లైన్ సాధనాన్ని ఉపయోగించవచ్చు. ఇది PDB ఫైల్‌ను దిగుమతి చేసుకోవడానికి మరియు దాని పరమాణు నిర్మాణాన్ని దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది.
మీరు జూమ్, రొటేట్, అధునాతన పోర్ట్ వీక్షణ టోగుల్, కెమెరా రీసెట్, ఎంపిక మోడ్ టోగుల్ మొదలైన కొన్ని ప్రాథమిక విజువలైజేషన్ ఫీచర్‌లను కనుగొనవచ్చు. ఇది కెమెరా మోడ్ (పర్‌స్పెక్టివ్ లేదా ఆర్థోగ్రాఫిక్), బ్యాక్‌గ్రౌండ్ కలర్ వంటి కొన్ని సెట్టింగ్‌లు లేదా కంట్రోల్ ఆప్షన్‌లను సర్దుబాటు చేయడానికి కూడా మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది. / ఆఫ్. మూసివేతను నిలిపివేయండి, పొగమంచు, క్లిప్పింగ్, స్థానం మొదలైనవాటిని ప్రారంభించండి/నిలిపివేయండి.
ఇది వస్తుంది యానిమేట్ చేయండి ఫంక్షన్. దీన్ని ఉపయోగించి, మీరు స్వయంచాలకంగా ప్రోటీన్ నిర్మాణాన్ని తిప్పవచ్చు. దీనితో, మీరు భ్రమణ వేగం మరియు కోణాన్ని సర్దుబాటు చేయవచ్చు. మీరు అంకితభావం కూడా పొందుతారు కొలత దానిలో సాధనం. ఈ సాధనాన్ని ఉపయోగించి, మీరు దూరం, ధోరణి, కోణం మరియు మరిన్ని వంటి బహుళ విలువలను కనుగొనవచ్చు.
ఈ లక్షణాలతో పాటు, అనేక ఇతర సులభ సాధనాలు అందుబాటులో ఉన్నాయి: స్ట్రక్చర్ మోటిఫ్ శోధన, భాగాలు జోడించడం, యానిమేషన్ ఎగుమతి, జ్యామితి ఎగుమతి (STL, OBJ, మొదలైనవి) మరియు మోడల్ ఎగుమతి.
మొత్తం మీద, ఇది విజువలైజేషన్ సాధనాల యొక్క గొప్ప సెట్‌తో నిజంగా మంచి ఉచిత ఆన్‌లైన్ PDB వ్యూయర్. మీరు ప్రయత్నించవచ్చు ఇక్కడ .
బి] మోల్సాఫ్ట్
మోల్సాఫ్ట్ అనేది PDB నిర్మాణాలను దృశ్యమానం చేయడానికి ఉపయోగించే మరొక ఆన్‌లైన్ సాధనం. ఇది ప్రాథమిక లక్షణాలతో కూడిన సాధారణ PDB ఫైల్ వ్యూయర్. మొదట, దాన్ని తెరవండి వెబ్ సైట్ మరియు మూడు-లేన్ మెను ఎంపికపై క్లిక్ చేయండి. ఆ తర్వాత, స్థానికంగా సేవ్ చేయబడిన PDB ఫైల్‌ను దిగుమతి చేయడానికి లేదా మీ Google డిస్క్ నుండి ఫైల్‌ను అప్‌లోడ్ చేయడానికి 'ఓపెన్' ఎంపికను ఎంచుకోండి. మీరు ఫైల్‌ను ఎంచుకున్నప్పుడు, అది వీక్షకుడిలోని పరమాణు నిర్మాణాన్ని మీకు చూపుతుంది.
నిర్మాణాన్ని దృశ్యమానం చేయడానికి మీరు విభిన్న వీక్షణ మోడ్‌లను ఉపయోగించవచ్చు. ఈ వీక్షణలలో వైర్‌ఫ్రేమ్, క్రియేటిన్ ఫాస్ఫోకినేస్ (CPK), బాల్ మరియు రాడ్, రిబ్బన్ మరియు మరిన్ని ఉన్నాయి. మీరు మీ అవసరాలకు అనుగుణంగా ఈ వీక్షణ మోడ్‌ల మధ్య సులభంగా మారవచ్చు. అదనంగా, ఇది నిర్మాణంపై మెరుగైన అవగాహన కోసం అణువు లేబుల్‌లు, అవశేష లేబుల్‌లు, హైడ్రోజన్ బాండ్‌లు మరియు సైట్‌లను ఎనేబుల్ చేయడానికి లేదా డిసేబుల్ చేయడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది.
ఇది కొలత సాధనాలను కూడా అందిస్తుంది. మీరు మోడల్‌లో దూరం, ఫ్లాట్ యాంగిల్ మరియు ట్విస్ట్ యాంగిల్‌ను కొలవవచ్చు. అదనంగా, ఫంక్షన్ ద్వారా అనుకూలమైన రంగు అందుబాటులో ఉంది, ఇది అణువు రకం, గొలుసు, అమరిక, ద్వితీయ నిర్మాణం మొదలైన వాటి ద్వారా నిర్మాణాన్ని రంగు వేయడానికి మిమ్మల్ని అనుమతిస్తుంది.
ఇది మీరు ఉచితంగా ప్రయత్నించగల మరొక మంచి ఆన్‌లైన్ PDB ఫైల్ వ్యూయర్.
ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ నుండి PDB ఫైల్‌ని డౌన్‌లోడ్ చేయడం ఎలా?
ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ నుండి PDB ఫైల్‌ను డౌన్‌లోడ్ చేయడానికి, మీరు ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ వెబ్‌సైట్‌ని సందర్శించి, ప్రోటీన్ లేదా స్థూల కణాల పేరును నమోదు చేసి, మానవ హిమోగ్లోబిన్, చిటినేస్ మొదలైన వాటి కోసం శోధించవచ్చు. ఆపై శోధన ఫలితాల నుండి ఫైల్‌ను ఎంచుకోండి మరియు PDB ఫైల్‌ను డౌన్‌లోడ్ చేయడానికి డౌన్‌లోడ్ ఎంపికను ఉపయోగించండి. సింపుల్ గా.
PDB నిర్మాణాలను ఎలా చూడాలి?
PDB యొక్క పరమాణు నిర్మాణాలను ప్రత్యేక ఆన్‌లైన్ సాధనం లేదా సాఫ్ట్వేర్ అప్లికేషన్‌ని ఉపయోగించి వీక్షించవచ్చు. మీరు మీ PCలో PDB నిర్మాణాలను దృశ్యమానం చేయడానికి మరియు విశ్లేషించడానికి IQmol, Swiss-PdbViewer మరియు CueMol వంటి ఉచిత సాఫ్ట్‌వేర్‌లను ప్రయత్నించవచ్చు. మీరు ఆన్‌లైన్ సాధనాన్ని ఉపయోగించాలనుకుంటే, అనేక ఎంపికలు ఉన్నాయి. ఉదాహరణకు, RCSB PDB మరియు Molsoft వంటి వెబ్ సేవలను ప్రయత్నించండి. ఇవి అధునాతన మాలిక్యులర్ విజువలైజేషన్ మరియు విశ్లేషణ సాధనాలను అందించే ఉచిత ఆన్‌లైన్ PDB ఫైల్ వీక్షకులు.
PDB ఫైల్‌ను PDFకి మార్చడం ఎలా?
PDB ఫైల్‌ను PDFకి మార్చడానికి, మీరు Molekel అనే ఈ ఉచిత డెస్క్‌టాప్ అప్లికేషన్‌ను ఉపయోగించవచ్చు. ఇది PDB ఫైల్‌ను PDF ఆకృతికి మార్చడానికి మిమ్మల్ని అనుమతించే ప్రత్యేక 'PDFకి సేవ్ చేయి' ఎంపికను అందిస్తుంది. మీరు PDB ఫైల్‌ని తెరిచి, PDBని PDFగా మార్చడానికి 'ఫైల్' > 'PDFకి సేవ్ చేయి'ని క్లిక్ చేయవచ్చు. మేము ఈ సాఫ్ట్‌వేర్‌ను ఈ పోస్ట్‌లో వివరంగా చర్చించాము, పైన దాన్ని తనిఖీ చేయండి.
అంతే.
ఇప్పుడు చదవండి: Windows కోసం ఉత్తమ ఉచిత మాలిక్యులర్ మోడలింగ్ సాఫ్ట్వేర్.
